短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeats,STR)是由2-6bp的重復(fù)單位串聯(lián)排列而成的一段DNA序列,通常簡(jiǎn)稱(chēng)STR(短串聯(lián)重復(fù)單位)。 這些重復(fù)序列廣泛存在于人類(lèi)基因組中,可作為高度多態(tài)性標(biāo)記,被稱(chēng)為細(xì)胞的DNA指紋。
STR基因座位上的等位基因可通過(guò)PCR擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來(lái)區(qū)分,在毛細(xì)管電泳分離之后可通過(guò)熒光檢測(cè)來(lái)識(shí)別,隨后通過(guò)一定的計(jì)算方法,即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專(zhuān)業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱(chēng)。
那么STR的鑒定結(jié)果能說(shuō)明什么呢?
STR的鑒定結(jié)果能證明以下問(wèn)題: 1. 是否為人源細(xì)胞;2. 是否為標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系;3. 是否存在物種內(nèi)交叉污染。
為什么要進(jìn)行STR鑒定?
據(jù)統(tǒng)計(jì),約18%~30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí),使用該細(xì)胞可能導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果等。